2006年，自治区党委、政府为加快广西北部湾经济区全面开放开发步伐，进一步加强泛北部湾区域经济合作，决定在南宁市规划建设区域性国际物流基地，通过广西北海、钦州、防城港沿海港口功能的延伸与在南宁市“无水港”口岸港区和大型保税加工区有机结合，优势互补，共同发展，进一步增强南宁市的综合竞争力，充分发挥南宁市在多区域合作中的核心带动作用，着力构建北部湾（广西）经济区大通道、大流通、大工业、大市场的发展新格局。

经过反复论证研究，南宁区域性国际物流基地初步选址于：北至湘桂铁路复线，西到银海大道，东至平乐大道附近的三角状区域，规划用地面积18.6平方公里，距市中心22公里，距南宁国际机场30公里，南边距离广西三大优良港口钦州港90公里、防城港120公里、北海港180公里。该物流基地设置南宁保税物流中心、出口加工区、商贸物流区、普通物流区、商务园（办公园区）、展览区、配套生活区及公园等八大功能区，拟建设成为设施一流、环境一流、管理一流的国际现代综合物流区和城市综合功能区，为中国—东盟自由贸易区的贸易往来、大西南出海通道的贸易往来以及泛珠三角经济区的贸易往来服务。

南宁区域性国际物流基地建设的重点是海关特殊监管区，即加快建设南宁玉洞保税物流中心，着力推进南宁、北海、钦州和防城港四城市“区港联动”的形成。自治区政府在今年2月27日向国家海关总署报送了《关于在北部湾（广西）经济区建设海关特殊监管区的专题报告》，提出要在南宁规划建设保税物流中心。为配合自治区的申报工作，我市随即制定了《南宁保税物流中心（B型）建设工作方案》，提出力争用2年时间，建成一个规划科学、功能完善、技术先进、运转高效、管理规范的服务于中国—东盟经济圈、西南经济圈和华南经济圈一流的现代化保税物流中心。

南宁保税物流中心规划面积为1平方公里，依托南宁高新技术开发区、南宁经济技术开发区、中国—东盟经济园区等我市及区内外大型的产业基地保税物流服务的需求，延伸港口的保税功能区，扩大综合服务功能，实现南宁、北海、钦州和防城港四城市的“区港联动”，形成具有一流软硬件设施和一定规模的国际物流节点，统一构建现代化的物流装卸堆场和电子口岸平台，提供完善的进出口货物订舱、报关、仓储、中转、配送等功能，实施“口岸分拨、多点申报、一次放行”的新型物流大通关模式，“十一五”期间，南宁玉洞保税物流中心将以保税仓库建设为主要内容，开办进出口货物保税仓储、国际物流分拨配送、简单加工和增值服务、进出口贸易、转口贸易、物流信息处理及其他经海关批准的国际业务，满足各方企业对采购、制造、运输、销售等物流一体化的要求，把物流基地发展成为采购中心、加工中心、配送中心、运输中心和信息交流中心，实现物流一体化服务。