南宁市约有植物209科764属2023种。其中,有国家一级珍稀濒危保护植物 “茶族皇后”的金花茶以及桫椤(树蕨),国家二级保护植物有福建柏、白豆杉、香花木、金丝李、枧木、格木、马蹄参、紫荆木等。
南宁果树树种繁多,有扁桃、人面子、荔枝、龙眼、杨桃、木菠萝、芒果、橄榄、板栗等。药用植物资源丰富,有名贵药材300多种,主要有砂仁、何首乌、桂党参等。南宁市自然分布的野生脊椎动物有31目90科208属294种,其中鱼类22种,两栖类19种,爬行类42种,鸟类151种,哺乳类60种。