为了管理好高新区辖区内北湖综合农贸市场、高峰农贸市场、建纳农贸市场、新村农贸市场、吉利隆农贸市场、科德农贸市场、相思湖农贸市场、罗文农贸市场、皂角农贸市场9个农贸市场，高新区用一个妙招即实行“责任保证金”制度，要求农贸市场开办者按照经营面积的大小交纳相应“责任保证金”。

每月底，高新区组织街道办、城管、工商等相关部门，严格按照“美丽南宁·整洁畅通有序大行动”检查验收标准，对每个市场进行考核，排名前三名的获得“先进市场”，每个市场获得5000元奖励，除此之外，会得到管委会追加奖金金额的30%作为物质奖励；排名后三名的被评为“最差市场”，每个市场都会被扣除5000元的责任保证金。

另外，为了让市民更好地辨认管理得好的农贸市场，高新区还实行“流动红旗”制度：每月对辖区农贸市场“美丽南宁·整洁畅通有序大行动”开展落实清洁进行一次考评，评出工作最好的三个市场授予“流动红旗”；对工作开展最差的三个市场，责令其立即整改并悬挂“流动黄旗”进行警告，整改达标后才可收回黄旗。市民凭“流动红旗”就可以选择秩序良好的农贸市场进行采购了。