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按照《广西北部湾经济区发展规划（2014年修订）》，根据空间布局和岸线分区，规划建设5个功能组团：

南宁组团。包括南宁市区及周边重点开发区，重点发展高技术产业、先进装备制造业、都市型工业、加工贸易、商贸业和金融、会展、物流等现代服务业，成为面向中国与东盟合作的区域性国际城市、综合交通枢纽和信息交流中心。

钦（州）防（城港）组团。包括钦州、防城港市区和临海工业区及沿海相关地区，发挥深水大港优势，规划建设北部湾自由贸易试验区，发展临海重化工业、新材料、能源产业、汽车、装备制造、修造船及海洋工程、造纸、粮油加工和港口物流等，成为利用两个市场、两种资源的加工制造基地和物流基地。

北海组团。包括北海市区、合浦县城区及周边重点开发区，发挥亚热带滨海旅游资源优势，开发滨海旅游和跨国旅游业，重点发展电子信息、生物制药、海洋开发等高技术产业、出口加工业和商贸、物流等现代服务业。

铁山港（龙潭）组团。包括北海市铁山港西岸和东岸、玉林市龙潭镇，充分发挥深水岸线和紧靠广东的区位优势，重点建设铁山港大能力泊位和深水航道，承接产业转移，重点发展能源、石化、林浆纸、新材料、先进装备制造、再生资源加工利用及现代服务业等产业。

东兴（凭祥）组团。包括东兴市、凭祥市城区和边境经济合作区及周边重点开发区，发挥通向东盟陆海大通道的门户作用，发展边境出口加工、商贸物流和边境旅游，加快建设东兴国家重点开发开放试验区、南宁—崇左—凭祥经济带，规划建设凭祥重点开发开放试验区、中国—越南跨境经济合作区。

此外，玉林市重点发展机械、医药、陶瓷等优势产业，崇左市重点发展糖业和锰业循环经济、出口加工等特色产业。